Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Arhgef5E9Q7D5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arhgef5E9Q7D5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arhgef5E9Q7D5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms