Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Srsf11E9Q6E5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Srsf11E9Q6E5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Srsf11E9Q6E5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Srsf11E9Q6E5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Srsf11E9Q6E5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Srsf11E9Q6E5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Srsf11E9Q6E5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms