Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85cE9Q6B2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85cE9Q6B2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms