Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5430401F13RikE9Q328 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
5430401F13RikE9Q328 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms