Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Abcc4E9Q236 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Abcc4E9Q236 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms