Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd2E9Q1M1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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