Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r68E9Q0V3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms