Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc1E9Q043 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc1E9Q043 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms