Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf11E9PZM7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf11E9PZM7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms