Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rsph10bE9PYQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rsph10bE9PYQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms