Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sfta2E9PXB6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms