Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim30dE9PWL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim30dE9PWL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms