Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ifit3bE9PV48 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ifit3bE9PV48 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms