Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AU019823E9PUQ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AU019823E9PUQ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AU019823E9PUQ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms