Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde2E9PUP1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms