Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam46aD3Z5S8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam46aD3Z5S8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms