Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms