Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms