Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc8D3YZV8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc8D3YZV8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms