Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc6D3YZP9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc6D3YZP9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms