Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kif28pD3YXS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kif28pD3YXS5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms