Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samd1D3YXK1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd1D3YXK1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms