Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmf1B9EKI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmf1B9EKI3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms