Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r180B9EK86 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r180B9EK86 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms