Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Phf11bB4XVQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Phf11bB4XVQ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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