Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pnldc1B2RXZ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pnldc1B2RXZ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms