Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia1B2RXQ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ppfia1B2RXQ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia1B2RXQ2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms