Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc11B2RXC1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc11B2RXC1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms