Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh2B2RVB7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh2B2RVB7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms