Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf3B2RUQ2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usf3B2RUQ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms