Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrt4B2RU40 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrt4B2RU40 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms