Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ythdc2B2RR83 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ythdc2B2RR83 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ythdc2B2RR83 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms