Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Brpf3B2KF05 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf3B2KF05 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms