Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd5B1AYB6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd5B1AYB6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd5B1AYB6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd5B1AYB6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms