Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap3aB1AWZ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms