Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scml2B1AVB3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scml2B1AVB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms