Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trabd2bB1ATG9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trabd2bB1ATG9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms