Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prr29B1ARI9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prr29B1ARI9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms