Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp36B1AQJ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms