Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930435E12RikA6X8Z9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms