Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CatsperbA2RTF1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CatsperbA2RTF1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms