Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Upf2A2AT37 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Upf2A2AT37 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms