Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr4A2ARI4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lgr4A2ARI4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms