Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ambra1A2AH22 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ambra1A2AH22 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ambra1A2AH22 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms