Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Cldn34dA2AGU5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn34dA2AGU5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms