Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmpd4A2AFR3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmpd4A2AFR3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms