Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Prdm16A2A935 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prdm16A2A935 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prdm16A2A935 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms