Protein–RNA interactions for Protein: A2A580

1700025C18Rik, MCG1027936, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025C18RikA2A580 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700025C18RikA2A580 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700025C18RikA2A580 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms