Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nlrp1bA1Z198 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp1bA1Z198 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms