Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc173A0JLY1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc173A0JLY1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms